O Projeto Paulo Werneck tem por objetivo preservar, catalogar e divulgar a obra do artista que marcou a paisagem arquitetônica brasileira com centenas de murais e desenvolveu de forma pioneira a utilização de mosaico cerâmico em empenas cegas e outras superfícies. O legado de sua obra abrange não apenas painéis, mas também um acervo armazenado em seu atelier que inclui cerca de 200 projetos em guache sobre papel, dezenas de ilustrações, documentos e fotografias.
A família do artista idealizou um conjunto de estratégias e ações que visam a preservação da obra do artista e a sua inserção na história do modernismo brasileiro.
Esta iniciativa já resultou no tombamento de dezenas de painéis na cidade do Rio de Janeiro; no reconhecimento da autoria dos painéis laterais da igreja da Pampulha; no restauro e preservação dos originais e catalogação do acervo; na realização de exposições no Rio de Janeiro, São Paulo e Brasília; na publicação de dois livros sobre o artista e na publicação do website do projeto.